A Faculdade Dom Pedro II entende que o atendimento ao professor e ao aluno como suporte a aprendizagem é de fundamental importância para o alcance da proposta pedagógica institucional. Dessa forma, busca através do apoio pedagógico promover o suporte ao processo de ensino/aprendizagem dos diversos Cursos da instituição. Para tanto, instituiu a Coordenação Pedagógica, órgão de apoio aos docentes e discentes em processos de ensino/aprendizagem assim como, para gerenciar conflitos pedagógicos na esfera da instituição.
Na estrutura da Coordenação Pedagógica funciona o NAP - Núcleo de Apoio Pedagógico, que serviço voltado ao atendimento do aluno de graduação e pós-graduação da Faculdade Dom Pedro II no que diz respeito ao desenvolvimento da sua carreira e sua adaptação à faculdade. O Núcleo acolhe alunos que queiram refletir sobre sua escolha profissional ou planejar a carreira, alunos com dificuldades relacionadas à escolha da profissão; adaptação ao curso ou com outras dificuldades que estejam interferindo na integração e no desempenho acadêmico
O NAP oferece basicamente três tipos de serviços: atendimento individual a alunos, oficinas com temas específicos e assessoria aos coordenadores nos projetos interdisciplinares acadêmicos. As oficinas são atividades coletivas de curta duração com um foco ou tema específico relacionado ao desenvolvimento de carreira ou adaptação à faculdade.